Ethidiumbromid

Ethidiumbromid hat die Summenformel C₂₁H₂₀BrN₃, eine Molmasse von 394,32 g/mol und ist gut in Wasser löslich. Der Farbstoff ist interkaliert zwischen die beiden Stränge der DNA und absorbiert UV-Licht (Wellenlängen von 254-366 nm). Es emittiert Licht mit einer Wellenlänge von 590 nm (orange-rot).

Ethidiumbromid wird zur Färbung von DNA-Proben verwendet, die über ein Agarose-Gel aufgetrennt wurden. Die Verbindung wird dabei direkt zum Gel hinzugefügt. Da die Bindung des Farbstoffs an die DNA die Emission verstärkt, kann die DNA spezifisch sichtbar gemacht werden, obwohl sich im gesamten Gel Ethidiumbromid befindet.

Ethidiumbromid gilt als potentiell karzinogen. Bei der Verwendung des Farbstoffes sind entsprechende Sicherheitsmaßnahmen zu ergreifen, um einen direkten Kontakt mit Haut und Schleimhaut zu verhindern.

Aufgrund der potentiellen Karzinogenität verwendet man heute in vielen Laboren alternative Farbstoffe, wie zum Beispiel Midori-Grün. Da bei diesen Farbstoffen eine Mutagenität ebenfalls nicht ausgeschlossen werden kann und sie um einiges teurer sind, ist Ethidiumbromid in vielen Laboren nach wie vor in Verwendung.

Ethidiumbromid ist nach Verwendung als gefährlicher Abfall nach lokalen Vorschriften zu entsorgen. Es darf dabei nicht in die Kanalisation gelangen. Meist wird Ethidiumbromid nach seiner Verwendung durch Adsorption an Aktivkohle inaktiviert und als fester Sondermüll in dafür vorgesehenen Behältern gesammelt.